1、首先是协商解决
2、其次是行政解决
3、再次是司法解决
4、最后，农村房屋所有权纠纷还可以通过人民调解来解决。
法律依据:
《中华人民共和国土地管理法》 第十六条 土地所有权和使用权争议，由当事人协商解决。“据此规定，公民之间发生的农村房屋所有权纠纷，应当先通过协商的方式加以解决。个人之间，个人与单位之间争议，由乡级人民政府或者县级以上人民政府处理。“该法还规定，侵犯土地的所有权或者使用权争议，由县级以上地方人民政府土地管理部门责令停止侵犯、赔偿损失。当事人对有关人民政府的处理决定不服的，可以在接到处理决定通知之日起30日内，向人民法院起诉。
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