法律分析：上司殴打员工运用法律保护的方法如下：及时报警，明显不构成轻伤的或者经法医鉴定不构成轻伤的，公安机关会按照治安案件对其进行行政处罚；经鉴定达到轻伤及以上的，其实施殴打行为人涉嫌故意伤害罪，需要负刑事责任。因为伤害行为遭受损害的，可以要求对方承担侵权责任，赔偿医疗费、护理费、误工费等费用。
法律依据：《中华人民共和国治安管理处罚法》第四十三条 殴打他人的，或者故意伤害他人身体的，处5日以上10日以下拘留，并处200元以上500元以下罚款；情节较轻的，处5日以下拘留或者500元以下罚款。
有下列情形之一的，处10日以上15日以下拘留，并处500元以上1000元以下罚款：
（一）结伙殴打、伤害他人的；
（二）殴打、伤害残疾人、孕妇、不满14周岁的人或者60周岁以上的人的；
（三）多次殴打、伤害他人或者一次殴打、伤害多人的。
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