1、微生物学在食品加工中的应用主要是微生物对食品中的有害微生物的控制来实现的。随着科学技术的发展，现在已经能够在食品加工过程中使用合适的微生物来控制食品中的有害微生物。
2、微生物学在食品加工中的应用还可以用于食品的保鲜。现在市场上有许多利用微生物进行食品保鲜的产品，例如在面包中添加酵母菌，可以使面包储存时间延长，并保持其柔软的口感。在肉类加工中，添加乳酸菌可以抑制肉类中的细菌滋生，避免肉类变质。通过微生物的应用，食品处理企业不仅能够降低食品储存的成本，也能够有效地减少浪费。
3、微生物学在食品加工中的应用还能用于发酵食品的制备。这些发酵食品不仅胃口好，而且营养丰富，对于人体健康有很好的影响。
