加班工资可以以调休代替，但需满足条件。根据《劳动法》，用人单位安排休息日加班且无法补休时，应支付不低于工资150%至200%的工资报酬。周末不加班不能倒扣工资，用人单位需遵守劳动定额标准，不得强迫加班。员工有权拒绝加班，不加班不算旷工，倒扣工资是不合理的。用人单位应按规定支付加班费。
法律分析
一、加班工资可不可以以调休代替
若用人单位安排加班的时间是休息日的，加班工资可以以调休代替。根据法律规定，用人单位休息日安排劳动者工作又不能安排补休的，支付不低于工资的百分之二百的工资报酬。
《中华人民共和国劳动法》第四十四条
有下列情形之一的，用人单位应当按照下列标准支付高于劳动者正常工作时间工资的工资报酬：
（一）安排劳动者延长工作时间的，支付不低于工资的百分之一百五十的工资报酬；
（二）休息日安排劳动者工作又不能安排补休的，支付不低于工资的百分之二百的工资报酬；
（三）法定休假日安排劳动者工作的，支付不低于工资的百分之三百的工资报酬。
二、周末不加班是否能倒扣工资
用人单位依法安排劳动者在休息日工作，而又不能安排补休的，按照不低于劳动合同规定的劳动者本人日或小时工资标准的200%支付劳动者工资。
用人单位应当严格执行劳动定额标准，不得强迫或者变相强迫劳动者加班。所以，企业安排加班时，要征求员工的同意，员工不同意加班时，企业不得强迫，员工有休息权。
所以，员工周末不加班，是不能算旷工的，周末本来就没有发工资，此时，再倒扣工资，无论扣多少，都是不合理的。
《劳动合同法》第三十一条
用人单位应当严格执行劳动定额标准，不得强迫或者变相强迫劳动者加班。用人单位安排加班的，应当按照国家有关规定向劳动者支付加班费。
结语
根据《中华人民共和国劳动法》第四十四条的规定，若用人单位安排劳动者在休息日工作又不能安排补休，应支付不低于工资的百分之二百的工资报酬。因此，加班工资可以以调休代替。而根据《劳动合同法》第三十一条的规定，用人单位应严格执行劳动定额标准，不得强迫或变相强迫劳动者加班。员工周末不加班是合理的，不能算旷工，因此倒扣工资是不合理的。企业在安排加班时应征求员工同意，并按照国家规定支付加班费。
法律依据
中华人民共和国劳动合同法（2012修正）：第四章劳动合同的解除和终止第四十四条【劳动合同的终止】有下列情形之一的，劳动合同终止：
（一）劳动合同期满的；
（二）劳动者开始依法享受基本养老保险待遇的；
（三）劳动者死亡，或者被人民法院宣告死亡或者宣告失踪的；
（四）用人单位被依法宣告破产的；
（五）用人单位被吊销营业执照、责令关闭、撤销或者用人单位决定提前解散的；
（六）法律、行政法规规定的其他情形。
中华人民共和国劳动合同法（2012修正）：第四章劳动合同的解除和终止第四十六条【经济补偿】有下列情形之一的，用人单位应当向劳动者支付经济补偿：
（一）劳动者依照本法第三十八条规定解除劳动合同的；
（二）用人单位依照本法第三十六条规定向劳动者提出解除劳动合同并与劳动者协商一致解除劳动合同的；
（三）用人单位依照本法第四十条规定解除劳动合同的；
（四）用人单位依照本法第四十一条第一款规定解除劳动合同的；
（五）除用人单位维持或者提高劳动合同约定条件续订劳动合同，劳动者不同意续订的情形外，依照本法第四十四条第一项规定终止固定期限劳动合同的；
（六）依照本法第四十四条第四项、第五项规定终止劳动合同的；
（七）法律、行政法规规定的其他情形。
中华人民共和国社会保险法：第十一章法律责任第八十五条用人单位拒不出具终止或者解除劳动关系证明的，依照《中华人民共和国劳动合同法》的规定处理。