医疗事故罪对赔偿一般有影响，通常只有在严重损害患者身体健康或造成患者死亡的情况下才会构成医疗事故罪，而医疗赔偿恰恰与患者受医疗损害的程度和等级有关，因此触犯医疗事故罪的医疗事故其赔偿往往越多。
《中华人民共和国刑法》第三百三十五条医务人员由于严重不负责任，造成就诊人死亡或者严重损害就诊人身体健康的，处三年以下有期徒刑或者拘役。《医疗事故处理条例》第五十五条医疗机构发生医疗事故的，由卫生行政部门根据医疗事故等级和情节，给予警告；情节严重的，责令限期停业整顿直至由原发证部门吊销执业许可证，对负有责任的医务人员依照刑法关于医疗事故罪的规定，依法追究刑事责任；尚不够刑事处罚的，依法给予行政处分或者纪律处分。对发生医疗事故的有关医务人员，除依照前款处罚外，卫生行政部门并可以责令暂停6个月以上1年以下执业活动；情节严重的，吊销其执业证书。