新生儿没上户口要报销新农合，要确定新农合上有给孩子交费，那样是可以报的。如果没有交费是不能报的。
新型农村合作医疗筹资工作流程：
1、登记审核阶段：各村参合人员以户为单位向本村村委会提供居民户口本，有村委会负责对本村符合条件人员的基本情况（包括姓名、性别、年龄、身份证号、与户主关系等），进行核实增减，最终上报确定人员名单一式四份（两份上交乡卫生办、一份公示、一份各村保存）；
2、初步审核阶段：各村村委会将本村参合人员信息核实后缴乡包村干部，由各包村干部对其所包行政村的参合人员核查统计表及所提供材料，进行初步审核把关；
3、复核审查阶段：乡卫生工作办公室对包村干部初审后的资料进行复核验收；
4、公开公示阶段：各村参合人员资料经乡卫生办复核验收后，各村以村为单位将登记结果张榜公示，接受群众监督；
5、汇总上报阶段：乡卫生工作办公室将公示后的结果进行汇总上报召陵区卫生局。
法律依据：《中华人民共和国社会保险法》第五条
县级以上人民政府将社会保险事业纳入国民经济和社会发展规划。国家多渠道筹集社会保险资金。县级以上人民政府对社会保险事业给予必要的经费支持。国家通过税收优惠政策支持社会保险事业。