侵犯商业秘密的刑事案件的管辖权和民事案件的管辖权有所不同，从管辖权法院的级别上来说，侵犯商业秘密的刑事案件一般由基层人民法院管辖。
一、案件受理管辖的法律规定
基层人民法院管辖危害国家安全案件、外国人犯罪案件之外的刑事案件;中级人民法院管辖危害国家安全案件、外国人犯罪案件和可能判处无期徒刑以上刑罚的案件;高级人民法院管辖全省(自治区、直辖市)性的重大刑事案件;最高法院管辖全国性的刑事案件。地域管辖是指同级人民法院之间在审理第一审刑事案件权限上的划分。我国刑事诉讼法规定了地狱管辖的一般原则，即以犯罪地人民法院管辖为主，被告人居住地人民法院管辖为辅原则;以最初受理的人民法院审判为主，主要犯罪地人民法院审判为辅原则。指定管辖在实践中，有时会发生人民法院因为管辖界限不明出现争议或推诿，或者有管辖权的法院不宜行使管辖权的现象。为了使案件得到及时、公正审判，法律赋予了上级人民法院确定或改变管辖的权力。我国刑事诉讼法规定：上级人民法院可以指定下级人民法院审判管辖不明的案件，也可以指定下级人民法院将案件移送其他人民法院审判。专门管辖专门管辖是指专门人民法院与普通人民法院之间，各种专门人民法院以及各专门人民法院系统内部在受理一审刑事案件受理范围上的分工。有刑事管辖权的专门法院是军事法院和铁路运输法院。军事法院管辖违反军人职责和危害国防军事的案件。铁路运输法院管辖的案件是铁路系统公安机关负责侦破的刑事案件。
二、约定管辖法院的范围
约定管辖的范围包括：合同或者其他财产权益纠纷，纠纷双方可以约定管辖权。但是只能约定地域管辖，不能对级别管辖进行约定。约定关系的注意事项有：1.在审理级别上，协议管辖仅适用于第一审民事案件2.在管辖类型上，协议管辖限于非专属管辖的诉3.在表现形式上，协议管辖为要式行为，必须采用书面形式。约定管辖的范围包括：合同或者其他财产权益纠纷，纠纷双方可以约定管辖权。但是只能约定地域管辖，不能对级别管辖进行约定。
三、我国实行什么审判制度
我国实行两审终审制，即经过两级人民法院的判决，即为终审判决，且只有一个生效的判决。
一般一审程序先有基层人民法院审理，中级人民法院审理二审案件。
特殊情况下，如果一个人被认为是可能被判处无期或有期徒刑的，根据我国法院级别管辖，由有管辖权的中级人民法院管辖。
【本文关联的相关法律依据】
《刑法》第二百一十九条，给商业秘密的权利人造成重大损失的，处三年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处罚金；造成特别严重后果的，处三年以上七年以下有期徒刑，并处罚金。