法律分析：
超员100的直接扣12分，并罚款2000元。以下是超员的处罚：1、驾驶车辆汽车人数超过核定数量的50以上的，一次扣12分；2、驾驶车辆汽车人数超过核定数量超过20以上不到50的，一次扣6分；3、驾驶车辆汽车人数超过核定数量但未达20的，一次扣3分。
法律依据：
《中华人民共和国道路交通安全法》 第九十二条 公路客运车辆载客超过额定乘员的，处二百元以上五百元以下罚款；超过额定乘员百分之二十或者违反规定载货的，处五百元以上二千元以下罚款。
货运机动车超过核定载质量的，处二百元以上五百元以下罚款；超过核定载质量百分之三十或者违反规定载客的，处五百元以上二千元以下罚款。
有前两款行为的，由公安机关交通管理部门扣留机动车至违法状态消除。
运输单位的车辆有本条第一款、第二款规定的情形，经处罚不改的，对直接负责的主管人员处二千元以上五千元以下罚款。