当事人因合同的履行过程之中发生合同纠纷，往往给一方当事人带来巨大的损失。所以，发生合同纠纷第一时间选择法律途径维护自己的合法权益，不是采用过激手段或默默承受损失。
一、发生运输合同纠纷如何处理
一、协商：当事人自行协商解决合同纠纷，是指合同纠纷的当事人，在自愿互谅的基础上自行解决合同纠纷的一种方式。
二、调解：合同纠纷的调解，是指双方当事人自愿在第三者（即调解的人）的主持下，在查明事实、分清是非的基础上，由第三者对纠纷双方当事人进行说明劝导，促使他们互谅互让，达成和解协议，从而解决纠纷的活动。
三、仲裁：即由第三者依据双方当事人在合同中订立的仲裁条款或自愿达成的仲裁协议，按照法律规定对合同争议事项进行居中裁断。四、诉讼：如果当事人一方不愿仲裁，则不能采用仲裁的方式、而只能采用诉讼的方式来解决双方当事人之间的争议。所以，诉讼是解决合同纠纷的最终形式。
二、合同诈骗罪与经济合同纠纷的界限
二者有相同之处，即都是合同的一方当事人没有履行或者没有完全履行合同，使对方受到损失，并且后者的一方在签定合同时也可能有某种欺骗性的因素，但是，前者是刑事犯罪，后者则是民事纠纷，二者有本质不同。
然而，在实践中，区分二者的界限往往是比较复杂的，二者的根本区别在于行为人有无履行合同的诚意，亦即是否具有非法占有对方财物的目的。没有这一目的，只是因为在履行合同过程中，因遭天灾人祸或市场变化等客观原因，使当事人无能力继续履行合同的，只能作为经济合同纠纷。
三、合同纠纷属于民事还是刑事
合同纠纷一般属于民事法律调整范畴，只有涉嫌合同诈骗罪，才由刑事法律调整。合同纠纷无外乎合因履
行合同而发生的争议、对合同内容的解释、合同的履行及违约责任、合同的变更中止等所发生争议纠纷，
此时合同当事人双方一般对于合同产生的纠纷可以申
请诉讼仲裁。如果一方是以非法占有为目的，在签
订、履行合同过程中，骗取对方当事人财物且数额较大的则构成合同诈骗罪。
【本文关联的相关法律依据】
《中华人民共和国民法典》
第五百七十七条当事人一方不履行合同义务或者履行合同义务不符合约定的，应当承担继续履行、采取补救措施或者赔偿损失等违约责任。
第五百七十八条当事人一方明确表示或者以自己的行为表明不履行合同义务的，对方可以在履行期限届满前请求其承担违约责任。
第五百七十九条当事人一方未支付价款、报酬、租金、利息，或者不履行其他金钱债务的，对方可以请求其支付。