有三个监狱。
1、湖州市区省属长湖监狱：浙江省长湖监狱始建于1951年，前身是湖州三天门劳改农场，于1974年选址长兴县李家巷镇白鹤岭恢复重建，2007年初，监狱搬迁湖州经济开发区新址，现老址暂保留十四监区一个关押点。
2、安吉县省属南湖监狱：浙江省南湖监狱创建于1952年11月20日。坐落于浙西北丘陵山区，位于浙江省湖州市安吉县境内，周边与长兴县和安徽省宣城市广德县相邻，与两省三县六个乡镇互相交错。
3、市区的市属湖州监狱：湖州市湖州监狱地处浙江湖州经济技术开发区，前身为湖州市劳动改造管教支队，1994年改名为湖州市湖州监狱。
