鱼的祖先是文昌鱼，文昌鱼是从无脊椎动物进化到脊椎动物的过渡种类，被视为鱼类起源的狭义上的祖先，此外，总鳍鱼类被认为是文昌鱼的直接祖先，而拉蒂迈鱼（矛尾鱼）是一种总鳍目的鱼类，它的发现为鱼类历史提供了重要线索。文昌鱼主要分布于中国，日本、托雷斯海峡、加里曼丹、新加坡、斯里兰卡以及非洲东海岸一带沿海也有分布，文昌鱼是适合在温暖海中的动物，其半截下身埋在沙中，仅以前端露出沙外，白天半截身体躲在沙砾之中，在阳光之下，依赖水流带来浮游生物及硅藻、植物供其食用。到了晚间离开沙窝，到水面活动，一旦遇到惊扰，又游回沙滩窝内，5-7月为文昌鱼生殖季节，一生中可繁殖3次，其中以最后一次产卵最多。寿命约2年8个月左右。
